Základem úspěchu je projekt se správným rozložením oken, které jsou v ideálním případě orientovány na jih. Zkušení projektanti se proto věnují rozložení oken až z 80 procent času. Kromě orientace oken je třeba také zohlednit tepelně-izolační vlastnosti i estetické požadavky majitelů domů.
Hlavním nedostatkem je méně slunečního svitu, než mají naši němečtí i rakouští sousedé. Aktivní tepelnou bilanci proto u nás mají pouze okna umístěná na jižní straně. Pasivní dům by z výše uvedených důvodů měl mít co nejvíce prosklených ploch na jižní straně. Naopak na severní straně by těchto ploch mělo být logicky co nejméně. Díky tomu se předejde dalším tepelným ztrátám. Prosklené plochy na východní a západní straně mají tepelnou bilanci vyrovnanou.
U pasivních domů jsou také lepší okna ve svislé poloze. Střešní okna nebývají příliš vhodná, protože jimi velmi často dochází k zatékání, rosení a v zimě dosahují výrazně menších solárních zisků.
Na tom, jak veliké prosklené plochy dům má, záleží také. Kvůli tepelným úsporám je proto vhodné umístit větší prosklené hmoty do hlavních obytných místností (obývací pokoj, ložnice a dětské pokoje). Díky orientaci na jih a velkým proskleným plochám je možné využít maximum sluneční energie. Navíc budou hlavní místnosti krásně prosluněné a více propojené s okolím.
Pozor však na možné letní přehřátí, ke kterému může dojít při špatné volbě velikosti oken. Obecně se doporučuje, že na jižní straně by měl podíl prosklených ploch činit maximálně 40 procent. Důležitá je nejen správná optimalizace velikosti a umístění oken, ale také stínící technika.
Nejen na velikosti, ale také na volbě materiálu záleží. Mluvíme-li o ekologickém bydlení, tak jsou v každém případě upřednostňována dřevěná okna. Kromě toho, že vypadají dobře, mají také přirozenou prodyšnost. Moderní jsou dřevohliníková okna, která jsou více odolná v namáhaných částech rámu.
Pozornost je třeba věnovat také typu zasklení, které by se mělo vyznačovat dobrou propustností a dvěma až třemi vrstvy skla. Nejlépe jsou na tom okna se třemi skly, které mají nejlepší tepelné i zvukové vlastnosti. Zároveň je také důležitá kvalita kování, těsnění a dalšího příslušenství.
Nejen samotná okna, ale také jejich osazení je důležité. To by měly provádět zásadně odborné firmy a výsledek si nechte ověřit tzv. blower-door testem, který zkontroluje vzduchotěsnost a zároveň stanoví energetickou náročnost. Správná montáž se vztahuje zejména k pečlivému těsnění spár tak, aby bylo zajištěné odvětrání, ale přitom nedocházelo k zatékání či ke kondenzaci vody uvnitř spár.